中國(guó)科學(xué)院亞熱帶農(nóng)業(yè)生態(tài)研究所（以下簡(jiǎn)稱(chēng)“亞熱帶生態(tài)所”）創(chuàng)建于1978年，其前身為中國(guó)科學(xué)院長(zhǎng)沙農(nóng)業(yè)現(xiàn)代化研究所，2003年10月改為現(xiàn)名。
亞熱帶生態(tài)所主要學(xué)科方向?yàn)閬啛釒?fù)合農(nóng)業(yè)生態(tài)系統(tǒng)生態(tài)學(xué)，下設(shè)喀斯特區(qū)域農(nóng)業(yè)生態(tài)研究中心、農(nóng)田生態(tài)研究中心、濕地農(nóng)業(yè)生態(tài)研究中心、流域農(nóng)業(yè)環(huán)境研究中心、畜禽健康養(yǎng)殖與農(nóng)牧復(fù)合生態(tài)研究中心、作物分子生態(tài)研究中心等六個(gè)研究中心，作為依托單位擁有畜禽養(yǎng)殖污染控制與資源化技術(shù)國(guó)家工程實(shí)驗(yàn)室、中國(guó)科學(xué)院亞熱帶農(nóng)業(yè)生態(tài)過(guò)程重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、農(nóng)業(yè)生態(tài)工程湖南省重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、動(dòng)物營(yíng)養(yǎng)生理與代謝過(guò)程湖南省重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、湖南省畜禽健康養(yǎng)殖工程技術(shù)研究中心和廣西石漠化治理工程技術(shù)研究中心，建有桃源農(nóng)業(yè)生態(tài)系統(tǒng)觀測(cè)研究站、環(huán)江喀斯特生態(tài)系統(tǒng)觀測(cè)研究站、洞庭湖濕地生態(tài)系統(tǒng)觀測(cè)研究站和長(zhǎng)沙農(nóng)業(yè)環(huán)境觀測(cè)研究站。
截至2023年底，亞熱帶生態(tài)所共有在冊(cè)職工203人。其中，中國(guó)工程院院士1人，國(guó)家“杰青”1人，國(guó)家“優(yōu)青”2人（含海外項(xiàng)目1人），國(guó)家百千萬(wàn)人才高層次人選2人，國(guó)家高層次人才特殊支持計(jì)劃入選者6人，全國(guó)優(yōu)秀科技工作者1人，國(guó)家“創(chuàng)新人才推進(jìn)計(jì)劃”中青年科技創(chuàng)新領(lǐng)軍人才1人、重點(diǎn)領(lǐng)域創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)2個(gè)，享受?chē)?guó)務(wù)院政府特殊津貼專(zhuān)家11人，中國(guó)科學(xué)院人才引進(jìn)計(jì)劃入選者9人、創(chuàng)新（青年）交叉團(tuán)隊(duì)2個(gè)、青年促進(jìn)會(huì)會(huì)員20人、青年促進(jìn)會(huì)優(yōu)秀會(huì)員6人、特聘研究崗位人員28人、“西部之光”入選者25人、“王寬誠(chéng)率先人才計(jì)劃”產(chǎn)研人才扶持項(xiàng)目1人，湖南省人才引進(jìn)計(jì)劃入選者2人、“杰青”13人、“優(yōu)青”2人、科技領(lǐng)軍人才5人、121創(chuàng)新人才培養(yǎng)工程入選者5人、光召科技獎(jiǎng)1人，“十大同心人物”2人、享受湖南省政府特殊津貼專(zhuān)家2人、湖湘青年英才6人、“三尖”創(chuàng)新人才14人，廣西省八桂學(xué)者2人，八桂青年學(xué)者2人。
現(xiàn)擁有生態(tài)學(xué)博士學(xué)位授予點(diǎn)，生態(tài)學(xué)、畜牧學(xué)以及環(huán)境工程學(xué)碩士學(xué)位授予點(diǎn)；有生態(tài)學(xué)專(zhuān)業(yè)學(xué)科博士后流動(dòng)站。目前在讀研究生192人（含國(guó)際學(xué)生2任），其中碩士生96人，博士生96人，在站博士后50余人。
亞熱帶生態(tài)所是湖南省生態(tài)學(xué)會(huì)、湖南省土壤學(xué)會(huì)、湖南省動(dòng)物營(yíng)養(yǎng)與生態(tài)環(huán)境學(xué)會(huì)掛靠單位，主辦有《農(nóng)業(yè)現(xiàn)代化研究》期刊。